ՀՀ ԳԱԱ պատմության ինստիտուտը հանդիսանում է ԱՊՀ պատմության ինստիտուտների Միջազգային Ասոցիացիայի անդամ, Ասոցիացիան հիմնադրվել է ԱՊՀ ակադեմիական պատմության ինստիտուտների կողմից ՌԴ մայրաքաղաք Մոսկվայում 2005թ. դեկտեմբերին: Ասոցիացիայի նախագահն է ՌԴ Գիտությունների ակադեմիայի Ընդհանուր պատմության ինստիտուտի տնօրեն, ՀՀ ԳԱԱ պատվավոր անդամ, ակադեմիկոս Ալեքսանդր Չուբարյանը: 

Գիտական համագործակցություն ՀՀ ԳԱԱ պատմության ինստիտուտի և Մոլդովայի հանրապետության գիտությունների ակադեմիայի պատմության, պետության և իրավունքի ինստիտուտի միջև:

Համագործակցություն «Հյուսիս-կովկասյան դաշնային համալսարանի» (ՌԴ) հետ:

Համագործակցություն Պազման պետերի կաթոլիկ համալսարանի հետ:

Համագործակցություն Տաջիկստանի Հանրապետության գիտությունների ակադեմիայի Ահմադ Դոնիշի անվան Պատմության, հնագիտության և էթնոգրաֆիայի ինստիտուտի հետ:

Համագործակցություն ՀՀ ԳԱԱ պատմության ինստիտուտի և Եգիպտոսի Արաբական Հանրապետության Այն Շամս համալսարանի իգական ֆակուլտետի պատմության բաժնի միջև:

Համագործակցություն Գորիսի պետական համալսարանի հետ: